二代測序（Next-Generation Sequencing，NGS）是指使用高通量平臺同時對大規(guī)模DNA或RNA進行快速、準(zhǔn)確、低成本的測序技術(shù)。在這個過程中，二代測序酶起到了重要作用。

　　二代測序酶主要分為兩類：聚合酶和核苷酸轉(zhuǎn)移酶。

　　1. 聚合酶

　　聚合酶是進行DNA擴增的關(guān)鍵工具，在PCR (Polymerase Chain Reaction) 過程中發(fā)揮著重要作用。其中最常見的是Taq DNA polymerase和Phusion DNA Polymerase兩種。

　　Taq DNA polymerase即熱穩(wěn)定型聚合酶，能夠耐受較高溫度條件下的反應(yīng)，并且擴增產(chǎn)物含有A尾巴（Adenines），適用于目標(biāo)片段長度較短且含有AT富集區(qū)域時使用；而Phusion DNA Polymerase則由多個不同來源的DNA polymerases組成復(fù)雜結(jié)構(gòu)體系，在保證特異性與靈敏度基礎(chǔ)上, 具備更好的擴增效率、精準(zhǔn)性及拓展模板長度等優(yōu)點。

　　2. 核苷酸轉(zhuǎn)移 酶

　　核苷轉(zhuǎn)移脫氧核糖體（Nucleotide Transfer and Deoxyribonucleotide Transfer）也稱為內(nèi)切酶，是一類蛋白質(zhì)酶，在DNA測序過程中扮演著重要的角色。這些內(nèi)切酶可以短小地識別和結(jié)合到DNA上，并在特定核苷酸位點處水解化學(xué)鍵，釋放出部分堿基或其它標(biāo)記物。

　　總之, 二代測序酶作為高通量平臺進行快速、準(zhǔn)確、低成本的基因組學(xué)研究所必備的關(guān)鍵工具, 具有極其重要和不可替換的作用。